TogoImputation

大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター様からの委託を受けて、 TogoImputation の開発を行なっています。TogoImputation は、SNPアレイデータのインピュテーション解析を支援するサービスです。国外の類似サービスとして ミシガン大学や TOPMed プロジェクト のウェブサービスが公開されています。これらのウェブサービスを利用するためには、ゲノムデータ（SNPアレイデータ）を国外のサーバにアップロードする必要がありました。

そこで、日本の研究者が利用しやすい日本版インピュテーションサービスとして、TogoImputation のシステムを開発しました。現在このシステムは、 国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステムの 個人ゲノム解析区画で利用可能です。

TogoImputation の詳細はこちらをご参照ください。

ヒト全ゲノムシークエンス多型解析ワークフロー

大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター様からの委託を受けて、ヒト全ゲノムシークエンス多型解析ワークフローの開発を行なっています。また、開発したワークフローを用いて、日本のヒトゲノムデータベースである Japanese Genotype-phenotype Archive (JGA) に蓄積されたヒトの全ゲノムシークエンス(whole genome sequencing; WGS)データを分析しています。

ヒト全ゲノムシークエンス多型解析ワークフローの詳細はこちらをご参照ください。